Il Servizio si occupa della prevenzione dell'inquinamento e degli interventi in materia di aria, acque superficiali, acque sotterranee, suolo e sottosuolo e onde elettromagnetiche, materie ambientali che hanno tutte responsabilità in campo penale oltre che amministrativo. Il Servizio si occupa dell'implementazione e gestione di una banca dati di tipo geologico, geomorfologico, idrogeologico. Il Servizio è la struttura tecnica di riferimento per: il corretto recepimento dei Piani Stralcio per l'Assetto Idrogeologico (PAI) – Fenomeni Gravitativi e Processi Erosivi – e Piano Stralcio Difesa Alluvioni, di competenza regionale; per la corretta applicazione del regime di tutela Idraulica dettato dal R.D. 523/1904, dall'art. 80 L.R. Urbanistica 18/83 e ss. mm. e ii, della L.R. 81/98, della L.R. 7/2003; della Microzonazione Sismica di Livello 1 e dei vincoli di natura idrogeologica in genere; le attività connesse al recepimento del nuovo Piano Regolatore Portuale.